Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms