Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms