Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FANCAO15360 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FANCAO15360 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FANCAO15360 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FANCAO15360 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FANCAO15360 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FANCAO15360 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FANCAO15360 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FANCAO15360 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FANCAO15360 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCAO15360 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCAO15360 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCAO15360 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCAO15360 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCAO15360 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCAO15360 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCAO15360 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCAO15360 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCAO15360 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCAO15360 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCAO15360 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCAO15360 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCAO15360 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCAO15360 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCAO15360 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCAO15360 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCAO15360 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCAO15360 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCAO15360 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCAO15360 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCAO15360 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCAO15360 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCAO15360 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCAO15360 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCAO15360 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCAO15360 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCAO15360 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCAO15360 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCAO15360 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCAO15360 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCAO15360 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCAO15360 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCAO15360 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCAO15360 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCAO15360 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms