Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCTN6O00399 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms