Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM3A6NNA2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms