Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NL46 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NL46 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NL46 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NL46 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NL46 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NL46 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NL46 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NL46 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NL46 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NL46 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NL46 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NL46 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NL46 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NL46 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NL46 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NL46 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NL46 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NL46 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NL46 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NL46 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NL46 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NL46 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NL46 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NL46 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms