Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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