Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms