Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms