Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP8A1Q9Y2Q0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms