Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms