Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms