Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms