Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNK0

STX8, Syntaxin-8, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX8Q9UNK0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX8Q9UNK0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX8Q9UNK0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms