Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC4Q9UBN4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
TRPC4Q9UBN4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRPC4Q9UBN4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRPC4Q9UBN4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC4Q9UBN4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC4Q9UBN4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC4Q9UBN4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC4Q9UBN4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC4Q9UBN4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC4Q9UBN4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC4Q9UBN4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC4Q9UBN4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC4Q9UBN4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC4Q9UBN4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC4Q9UBN4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC4Q9UBN4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC4Q9UBN4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC4Q9UBN4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC4Q9UBN4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC4Q9UBN4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC4Q9UBN4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC4Q9UBN4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms