Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms