Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms