Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms