Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms