Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A1Q9NWF4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A1Q9NWF4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms