Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144 ms