Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM30AQ9NV96 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM30AQ9NV96 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM30AQ9NV96 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM30AQ9NV96 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM30AQ9NV96 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM30AQ9NV96 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM30AQ9NV96 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM30AQ9NV96 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM30AQ9NV96 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM30AQ9NV96 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30AQ9NV96 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms