Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TDP1Q9NUW8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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