Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTPS2Q9NRF8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms