Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms