Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms