Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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