Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTRT3Q9BYD9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms