Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms