Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms