Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBF4Q9BQW3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms