Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FYCO1Q9BQS8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms