Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPG4P5Q96PW8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms