Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms