Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms