Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms