Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARF2Q96GP6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms