Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGF29Q96ES7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms