Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms