Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms