Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMTQ93088 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms