Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCN1Q92616 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCN1Q92616 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCN1Q92616 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCN1Q92616 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCN1Q92616 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCN1Q92616 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCN1Q92616 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCN1Q92616 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCN1Q92616 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCN1Q92616 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCN1Q92616 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCN1Q92616 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCN1Q92616 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GCN1Q92616 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GCN1Q92616 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCN1Q92616 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms