Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT9Q92600 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms