Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC12Q8WUD4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms