Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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ZNF548Q8NEK5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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