Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q8NBF6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AVL9Q8NBF6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms