Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms