Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms