Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms