Protein–RNA interactions for Protein: Q70UQ0

IKBIP, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBIPQ70UQ0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms